时间：2022-12-12 16:30:01 | 来源：信息时代
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比对搜索工具 : 一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具,它的产生是基于Altschul等人1990年在J.Mol.Biol.上发表的论文。
BLAST程序能将某个DNA或蛋白质序列与已知的生物序列数据库中的序列进行快速相似性比对。BLAST计算结果中的得分是对序列相似性程度的一种度量。BLAST采用一种局部算法可以获得两个序列中具有相似性的序列片段,它基于匹配短序列片段,利用随机过程中的似然分析来确定未知序列与数据库序列的最佳局部联配。
BLAST可以下载公共数据库,用于本地查询。也可以通过Internet直接到网上查询(即netblast)。提交待查序列的方法有3种: 用E-mail、委托程序或WWW界面提交序列。三种方法均由以下四个部分构成:①选择相关程序(即查询方式,如BLASTP,BLASTX等等);②查询的数据库名称;③格式及修饰物; ④查询序列。
BLAST是一个包括以下五种序列数据库搜索的程序家族: ①BLASTP是在蛋白质数据库中进行相似蛋白质序列的搜索; ②BLASTX是在蛋白质数据库中进行相似核酸序列的搜索; ③BLASTN是在核酸数据库中进行相似核酸序列的搜索; ④TBLASTN是在核酸数据库中进行相似蛋白质序列的搜索; ⑤TBLASTX是在核酸数据库中进行相似核酸序列的搜索。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白,由于每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列,这样每次比对会产生36种比对阵列。通常根据查询序列的类型(蛋白或核酸)来决定选用何种BLAST。
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