时间：2022-12-03 22:30:01 | 来源：信息时代
时间：2022-12-03 22:30:01 来源：信息时代
序列检索系统 : 由欧洲分子生物学实验室(EMBL)研制的一个基于Web的查询系统,也是国际上最有影响的生物分子数据库查询系统之一。SRS采用全菜单驱动方式,用户可以用SRS迅速访问生物分子数据库和文献数据库,从而查到符合条件的序列。
SRS的系统组成如下:
(1)快速搜索栏:包括执行快速搜索中的一个装载分析工具; 访问数据库获得相关信息; 访问在线文档; 开始一个持久项目。
(2) View Manager: 包括给新的view命名; 选择一组将被用到的域;选择某个view定义的数据库;删除已经定义的用户view;
(3) Link选项: 可以用Link工具查询与已知结果相关的条目。
(4)分析工具: 允许SRS用户利用各种生物信息学工具来分析得到的结果,可以用特定的序列信息来提炼所得到的搜索结果。
(5) DataBanks选项: 包含在当地站点可以访问的数据库信息,如每个数据库中的条目数,索引日期,可获得的数据库状态等。
(6)将用户的反馈信息提交系统。
SRS中的数据库包括: 一级数据库EMBL、EMBL NEW、SWISS-PORT、PIR; 二级数据库蛋白质家族和结构域数据库PROSITE、限制酶数据库ReBase、PDB序列子集数据库NRL 3D、真核基因启动子数据库EPD、E.coli数据库ECD、酶名称和反应数据库ENZYME、生物计算文献数据库SEQANALREF等,还有与功能、疾病相关的数据库,总共有80多个数据库。
除了查询和获取数据功能之外,SRS还带有许多嵌入式工具,如分子疏水性显示、相似性搜索、多重序列比对等工具。
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