分子生物学实验中有哪些常用的软件？
时间：2023-12-07 07:54:01 | 来源：网站运营
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分子生物学实验中有哪些常用的软件？：
分子克隆：SnapGene
http://www.snapgene.com/遇见SnapGene之前大概使用过十几种分子克隆软件，直到有一天遇到了SnapGene，发现它差不多集成了之前十几种软件的优点，同时摒弃了它们所有的缺点。最关键的一点，是精致打磨的设计感。真的美，美出声。
特别是2.0版本之后出现的多序列比对功能，美妙极了。
说几个很出彩的功能：
- 多序列比对，刚说过了，谁用谁知道
- 自动检测常规特征（Common Feature）
- 自动引物设计。这里吐槽一下Primer Premier, 这个软件上市的时候，PCR酶还很弱小，引物质量会对结果产生比较大的影响，所以这个专门用来设计引物的软件考虑了很多的因素，难用一点也忍了。这么多年过去了，PCR酶已经非常强大，引物质量对结果的影响越来越小了，PP这种软件太过时了。相反SnapGene的引物设计恰到好处，简单直接。
- 支持Gibson Assembly，还可以自动设计引物。这里吐槽一下Vector NTI，有谁知道Vector NTI最新的版本11.5是哪年发布的吗？2010年，五年没更新过了。。
- 直接导入Genbank 序列号
太多了，不想写了。
最后再说下SnapGene的价格，单一授权 $350/年，或$750/永久。
文献阅读：ReadCube
ReadCube是以文献阅读为中心的文献管理软件，不同于EndNote那种以引文为核心的管理软件。
自动识别PDF文档中的信息，比如题目、作者、摘要、引文。对于生命科学的文献还是非常准确的，几年前听说其他领域的论文识别准确度不高，不知道现在改进没有。
可以找到全文下载的连接，还可以通过大学图书馆的代理访问全文数据库。
ReadCube和Nature有合作，大家读Nature论文的时候都能看到。
说几个亮点：
- 根据你的文献数据库，推荐和你研究兴趣最相关的文献
- SmartCite：在Word里双击Ctrl可以插入参考文献。但是很难用，看来EndNote那种技术还是有点难度的。
- 免费！！！增值服务收费，$5/m，主要是云同步功能和引文趋势信息。
- 有iOS和Android客户端，有云同步的话还是很爽的。
实验记录：Microsoft Office OneNote
个人感觉OneNote绝对可以成为一种宗教...
用OneNote做实验记录是一种怎样的体验呢？顺滑。
两年前花费了一段时间在OneNote上建立实验记录的规则，感觉就是需要的功能都以最舒服的方式摆在那里供我使用。
其实也不全是，还是有极少数想要的功能没有的，摊手。等待Office 2016吧。
亮点太多了，不知道从哪说起：
- 可以查询每一个字是在什么时间写下的，谁写下的（多人编辑的时候）。
- 随时随地的计算器，做着笔记如果要算个乘法，只需要输入 “3*5=”，然后按下空格，直接显示结果。
- 快捷键：检查框、创建表格、输入当前时间等等
- 云同步和协作编辑。但是OneDrive经常抽风，给中评。
- 自动保存。自动保存就是你的光标停留在哪里，然后断电了，来电了，你打开电脑，光标还在那里。
- 全局搜索，有Ctrl+E 和Ctrl+F两种搜索，不一样，很玄妙。
太多了，OneNote真的很棒，如果你恰好还有一台Surface就更棒了，感觉像活在未来。
还有一些软件，没有上面这么常用，以后再写吧。
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