基因帮搭建科研服务的桥梁
时间：2022-03-14 09:09:02 | 来源：行业动态
时间：2022-03-14 09:09:02 来源：行业动态
因为SienceEXChange在线科研服务交易平台的成功，也让生命基线萌生建立在线交易平台的设想，把优秀的资源集中起来，再分发给研究人员和有科研需求的医院医生。
这也是在简基之前，2015年就产生的基因帮，其致力解决科研人员在科研过程中各个环节的需求，提供基因测序及测序数据分析服务。科研人员在平台上提交需求，基因帮进行工程师匹配，双方取得联系，明确收费和交付时间。在这个过程中基因帮作为一个第三方平台，将对项目预付款、项目进度进行把控和监管。
大部分科研工作者专注于实验研究和探索生物学规律，分析工作通常是与公司合作进行。凌之浩介绍到，基因帮不仅覆盖了基因组学，还有像蛋白组学、转录组学、代谢组学等数据分析服务，而且华大基因、诺禾致源等公司也入住了平台。
最开始基因帮通过本地数据中心为科研机构提供服务，机房托管了6台服务器，随着交易量的增长，越来越多的分析样本已经很难满足，有时甚至需要同时开启几百甚至上千台服务器来满足计算需求。而且大数据分析场景中的高通量数据传输以及如何将结果已更加高效方式呈现给终端用户也是客户面临的问题，生命基线也开始寻求通过云来继续提供优质服务。
在陆陆续续使用了超算和一些云计算平台后，基因帮最终在半年前正式切换到AWS。对于选择亚马逊AWS的原因，凌之浩开玩笑说，因为公司的对面就是AWS。其实选择AWS出于成本和服务两方面因素考虑。
通过数百台Amazon EC2 Spot实例基因帮获得所需要的计算能力，使用命令行工具，配合EC2，以及启动脚本来进行快速的部署，利用S3来储存样本数据和最终结果。基因帮可以在 Amazon EC2 Spot实例请求中指定出价，从而选择愿意为实例支付的每小时价格，这一模式非常适合测试和开发环境。
现在几分钟就可以部署上百台服务器实现计算分析任务，并在计算完成后自动关闭实例。根据业务需求自动的进行弹性扩展所需要的实例，极大的降低了运维的压力。
目前基因帮已经与众多高等院校和机构合作，包括四川大学华西医院、成都中医药大学、四川农业大学、浙江大学等全国范围的高校与科研院所。同时基因帮还推出了试剂耗材商城、测序商城、基因帮生物云等服务，使得业务日益丰富。
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