更快、更强是基因测序领域对于高性能计算的核心需求
时间：2022-03-24 11:09:01 | 来源：行业动态
时间：2022-03-24 11:09:01 来源：行业动态
大家知道基因测序技术已被列为国家重点发展产业。据研究，每年的基因测序分析增长会在30%以上，数据量也将是越来越多，如何传输、保存和管理海量的基因数据是一个非常棘手的问题。为解决这一现状，HPC正被广泛应用于基因测序行业。在目前国内基因测序领域，诺禾致源是当之无愧的佼佼者，诺禾致源的业务覆盖科技服务、肿瘤基因检测及遗传检测三大领域，为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。其中科研服务的内容是为科研院校、医院、药企提供测序的服务，从测序到后续的数据分析，最后给到客户分析报告，以便客户根据相应的实验设计挖掘出数据具体的生物学意义。
包括基因测序在内的生命科学研究对于高性能计算的需求是刚需。随着基因测序过程数据量的增幅速度加快。一方面需要对测序结果更快的呈现，一方面对于海量数据有极高的存储需求。
诺禾致源高级副总裁吴俊谈到基因测序环节几年前需要7到8天，平均每天机器采集的数据量是200到300GB，现在测序环节只需要2.5天，但是数据量增减到6TB，这就面临一个问题，测序量又增大，时间减少，如何解决计算的问题。
因此对于高性能计算的需求是一方面是高性能计算的配置要足够的优化，另外针对数据量比较大，每次数据收回意味着每一次成本都非常高，因此IO的读写速度也要跟得上，包括一些并行化的要求，吴俊谈到。
同时针对计算量和数据量海量的特征以及后续增长速度高的特点，诺禾致源采用了自建数据中心机房来解决成本以及本身业务的特殊性需求。
目前诺禾致源已在全球运行25台NovaSeq、20台PacBio Sequel、30台HiSeq X、11台HiSeq 2000/2500/4000、4台MiSeq、4台NextSeq 500、6台Life Ion Proton（DA8600）、2台S5XL和5套Q Exactive HF-X等最先进的基因测序仪，建立了亚洲通量规模最大的基因测序平台，将实现每年280,000人全基因组测序的超高通量。同时，全国首家引入Q Exactive HF-X高端质谱平台，打造最先进的生物质谱中心，为客户提供全面、深入的多组学解决方案。
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