医学文献检索总结
时间:2023-03-17 05:42:01 | 来源:电子商务
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绪论
1.信息素养:又被称为信息素质,全球信息化需要人们具备的能力。是指判断何时、何地需要信息、并有效搜集、评估和使用所需信息的能力。信息素养是终身学习的必然要求
2.信息素养的内涵:1信息意识2信息知识3信息能力4信息道德
3.信息意识是指人们从信息的角度去理解、感受和评价自然现象和社会现象,反映人们对信息的敏感度与注意力、对信息价值的判断力和洞察力,以及捕捉、反馈、分析、判断和吸收信息的自觉程度。
医学生的信息意识可划分为三个方面:领域意识 前沿意识 线索意识
4.信息知识是指涉及信息活动所必须具备的基本原理、概念和方法性知识。a.医学信息基础知识:信息术语、信息源概念 b.现代信息技术知识:医院信息系统、病历 c.医学专业外语知识:阅读和听说能力
5.信息能力是指人们有效利用信息设备和信息资源获取信息、加工信息以及创作和交流信息的能力。信息需求能力,常用信息工具的使用能力和信息技术的应用能力,信息获取与识别能力,信息加工与处理能力,信息创造与传递能力,终身学习能力
6.信息道德是指人们在信息活动中应该遵守的伦理道德规范。对于医学生而言信息道德还包括能够自觉保护病人、同事和他人的私密信息,并且尊重病人隐私。
7.三者的关系:信息知识是信息素养的基础层次;信息能力是信息素养的能力层次,也是信息素养的核心;信息道德是信息素养的思想保障.
8.信息素养评价标准:a.2000年《美国高等教育信息素养能力标准》(美国大学与研究型图书馆协会指导委员会,ACRL)b. 200年《全球医学教育最低基本要求》(国际医学教育研究所,IIME) c. 2009年我国《医学生信息素养能力指标体系(修订稿)》 (中国医学科学院医学信息研究所)
内容:a.能够确定所需信息的性质和范围b.能够有效地获取所需信息c.能够正确的评价信息及其信息源
d.能够管理其获取的信息,并采用适当的方式交流表达信息e. 能够将选择的信息融入自身知识体系,形成新的知识体系f.能够了解信息素养是终身学习的重要组成部分,并关注专业领域的最新进展g. 能够合理、合法地检索和利用信息
9.信息素养教育一般分为综合信息素养和专业信息素养,与综合信息素养相比,专业信息素养更多地关注专业信息的获取和处理与利用,更强调为专业学习和职业决策服务。
医学信息素养教育属于专业信息素养范畴。
10.医学信息检索与利用课程学习意义:促进医学专业学习,提高科研创新能力,培养终生学习能力
第一章 信息检索基础
1.信息的概念:广义—信息是对各种事物的存在方式、运动状态和相互联系特征的一种表达和陈述,是自然界、人类社会和人类思维活动普遍存在的一切物质和事物的属性。
狭义—信息是指具有新内容或新知识的消息,即对接受者来说预先不知道的报道。
信息的分类(按照信息的属性划分):文字信息、图像信息、数值数据信息、语音信息
信息的特征:客观性、可知性、传递性、无限性、时效性
2.信息资源是人类在认识世界与改造世界过程中所产生、整理和记录有用信息的集合。信息资源是经过人类选取、组织、序化的有用信息的集合。
信息资源三层含义:信息的总和或集合; 信息的有用性;信息的有序化。
3.信息资源类型按载体形式划分:a.书写型 b.印刷型 c.缩微型信息资源d.视听型 e.电子型:电子文献存储的文件主要有:文本型;超文本型;多媒体型等
按照信息出版形式:1图书(包括著作书籍和工具书,工具书又分为检索工具书和参考工具书)2期刊(也称杂志,是一种采用固定刊名,定期或不定期出版的连续出版物。出版周期短、报道速度快、信息量大、内容新颖)ISSN(International Standard Serial Number,国际标准连续出版物编号例:ISSN1673-6036)
CN(国内标准刊号例:CN 11-5447/R)3特种文献(特种文献是出版形式比较特殊的文献的总称,又称非书、非刊资料。一般不公开出版); 特种文献主要包括:科技报告、会议文献、专利文献、标准文献、学位论文、档案资料和产品资料等
按照信息内容的加工级次:一次文献(又称原始文献,是首次公开发表的文献,直接记录了科研成果,报道了新发明、新技术、新知识和新观点。特点:数量庞大,分散而无序;电子型与印刷型并存;发表分散,老化加快);二次文献(又称检索工具。是对许多无序的、分散的一次文献进行收集整理,著录其特征,并按照一定的顺序加以编排,形成系统,便于检索的文献。具有检索功能。作用:揭示和报道一次文献,提供查找一次文献的线索);三次文献(是利用二次文献并在其指引下,对大量的一次文献进行综合分析研究,加以浓缩和提炼而成的文献;特点:综合性强、信息量大、参考价值大);零次文献(是指未经信息加工,直接记录在载体上的原始信息,如实验数据、观测记录、调查材料等)
一次文献主要包括:专著、期刊论文、科技报告、会议文献、学位论文、专利文献等
二次文献主要包括:题录、书目、索引和文摘
三次文献包括:综述、述评、进展、预测等,各类词典、手册、年鉴、百科全书、指南等参考工具书
一次文献、二次文献、三次文献的关系:从一次文献到二次文献、三次文献是一个由分散到集中、由无序到有序的过程。一次文献是检索的对象,二次文献是存储文献、报道文献和检索文献的工具,是查找原始文献的线索,但不能代替原始文献,三次文献是信息调研的结果,是经过集中和浓缩的文献
4.信息资源的特征 1).智能性2).有限性3).不均衡性4).整体性
5.信息检索:是指通过一定的方法,从信息集合中查出特定信息的过程。
6.信息检索原理:是指通过一定的方法和手段使存储和检索这两个过程所采用的特征标识达到一致,以便有效获取和利用信息。
信息存储过程:提取——特征:作者、出处、标题等;标引——外表、内容特征标识规范化处理(作者、篇名、主题词等);编排——特征标识
检索过程:分析——信息需求;确定——主要概念、查找范围(时间、国内外等);设计——检索方案(检索词+逻辑关系);比较、筛选——检索词 VS 特征标识(机检中由计算机完成匹配和输出)
计算机检索的特征:机械匹配,而非概念匹配。例如:输入finding, 检出finding;输入findings, 检出findings
7.信息检索类型:文献型信息检索:又称文献信息检索,通常以某些特定的文献为检索对象,其检索结果是切题文献或相关文献的线索或全文,是一种相关性检索。根据检出内容,文献检索又可分为书目信息检索和全文信息检索。数据型信息检索:又称数值检索,检索对象为特定的数值数据,包括物质的各种理化参数、观测数据以及各类统计数字等数值类数据,也包括图表、化学结构式、计算公式等数据。事实型信息检索:以事项为检索目的和对象,又称事项检索。检索结果是有关某一事物的具体答案。如:概念、思想、人物等。
8.检索语言根据文献信息存储与检索的需要而创造的,用来描述文献的特征和表达检索提问的一种人工语言。包括标引语言,索引语言,检索语言
检索语言的作用(1)是信息管理人员和信息检索者共同约定使用的语言,是沟通信息存储与检索的桥梁。(2)用来描述文献外部特征和内容(主题)特征
文献的外部特征:包括题目、作者、作者工作单位,发表时间、专利号、报告号等。
文献的内容(主题)特征:各种形式的主题词、关键词和分类号。
检索语言(广义)按描述的文献特征划分:按描述文献内容特征的语言(狭义):分类检索语言,主题检索语言(主题词,关键词),代码检索语言;描述文献外部特征的语言:作者,作者单位,刊(书)名
9.分类检索语言:用分类号来表达各种概念,将各种概念按学科性质进行分类和系统排列。我国较为广泛使用的分类检索语言:《中国图书馆分类法》(简称《中图法》)。中国图书馆分类法分类表共分22个大类,再分17个二级目录,医药卫生属于R大类。
10.主题检索语言:用语词表达各种概念,将各种概念不管其相互关系,完全按字顺排列。包括主题词和关键词。a.主题词 :叙词(descriptor),是经人工规范化处理的,最能表达文中主题概念的语词。所谓规范化处理,是指在文献存储时,对文献中的近义词、同义词、拼写变异词、全程缩写等加以严格控制和规范,使同一主题概念的文献相对集中在一个主题下,体现主题词的单一性,也叫人工受控语言。
医学主题词表(MeSH):英文名称:Medical Subject Headings英文缩写:MeSH研制单位:美国国立医学图书馆(NLM);CBM、PubMed和MEDLINE都以此表为依据进行主题标引。用途:对生物医学文献进行标引和检索的权威性术语控制工具
主题词检索的优点:查全同义词、及下位概念;提高文献相关度
主题词检索的缺点:人工标引速度慢,最新论文未标规范主题词;新词、一些很专指的概念没有对应的主题词,应结合自由词检索
b.关键词: 键词(keyword),是从文献的题名、摘要、章节标题或正文中抽取出来的,具有实质意义、并能表达文章的主题内容,但未经规范化处理,需由检索者在检索时加以控制使用。又称后控语言、非规范化语言,属于自然语言范畴
11.代码检索语言:代码检索语言是根据文献信息中论述事物的代码作为标识,加以标引和排列的检索语言。
例如:化合物的分子式索引系统,环化合物的环系索引系统
12.检索途径:分类途径,主题途径,关键词途径,题名途径,著者途径,引文途径,机构途径,默认途径(默认途径又称缺省途径,指在检索系统预先设定的多个字段中检索。如:中国知网中的“主题”检索,就是默认检索,默认在中英文篇名、中英文关键词、中英文摘要这些字段中检索。默认检索比选择某一字段检索得到的检索结果要多;计算机检索),其他途径
13.不同检索途径常用字段名称:题名途径:题名、标题、篇名、题目、title;分类检索途径:分类号,中图分类号;主题途径:主题词、MeSH、MeSH terms、 Thesaurus、map term to subject headings ;关键词途径:关键词、keywords、text words;著者途径:(第一)作者、著者、责任者、author、first author;引文途径:引文、参考文献、reference、cited author、cited reference、cited work;机构途径:机构、单位、地址、organization、institute、address;刊名途径:刊名、来源、出处、journal、source;默认途径:缺省、主题
14.检索效果评价:查全率和漏检率;查准率和误检率;其他指标
查全率=检中的相关信息量/系统中的相关信息总量×100% 漏检率=(1-检中的相关信息量/系统中的相关信息总量)×100% 查准率=检中的相关信息量/检出的信息总量×100% 误检率=(1-检中的相关信息量/检出的信息总量)×100%
15.信息检索系统是指根据人类对知识信息的普遍性需要,由一定的硬件设备和软件条件构成,具有选择、整理、加工、存储和检索信息功能的有序化信息资源集合体。
16.数据库的概念:是指一定专业范围内的信息记录及其索引的集合体。是计算机信息检索系统的重要组成部分。包括文献数据库(分为书目数据库和全文数据库),数值数据库(主要包含的是数值数据),事实数据库(存储的是用来描述人物、机构、事物等对象的事实性信息。如名人录、机构指南、大事记等。
例:美国MEDLARS系统的医生咨询数据库(PDQ)能提供有关癌症治疗和临床实验的相关病因、诊断标准、治疗方案以及最新研究进展等信息),多媒体数据库(数据库技术与多媒体技术相结合的产物,存储文字、图像、视频、音频等多种信息)
(1)书目数据库—是检索工具,存储的是二次文献,检索结果是所需文献的线索而非原文(例:中国生物医学文献数据库CBM、MEDLINE、PubMed)。
(2)全文数据库:存储的是原始文献的全文(一次文献),如期刊论文、学位论文、会议论文等数据库。
例:中国知网,万方数据知识服务平台(检索平台),维普期刊资源整合服务平台(期刊),OVID
17.按数据库的组成层次:文档(数据库中一部分记录的集合。)、记录(是构成数据库的一个完整的基本信息单元,每条记录描述了一原始信息的外部特征和内容特征)、字段(是比记录更小的信息单元,是组成记录的数据项目。)
按数据库组成方式1.顺排文档:以记录为单位,按记录的入藏顺序号从小到大排列而成的记录集合,也称主文档。2.倒排文档:从顺排文档中把记录的具有检索意义的特征提取出来,附带其在主文档中的位置标识,把这些数据按照一定顺序重新排列形成新的文档,也称索引文档。
18.文本信息检索技术:(1)布尔逻辑检索:在检索过程中用于表达词于词之间的逻辑关系的算符就称为布尔逻辑运算符。关系包括逻辑与、逻辑或、逻辑非;分别用AND、OR、NOT表示。
逻辑“与” (积):AND(*):A and B,检索结果是数据库中同时含有概念A和概念B的文献。作用:缩小检索范围,提高检索结果的查准率
逻辑“或”(和):OR(+):A OR B,记录中出现检索词A或检索词B或两词同时出现在一条记录中。
作用:扩大检索范围,提高查全率
逻辑非(差):NOT(-)A NOT B,记录必须包含检索词A但不能包含检索词B。即在含有A检索词的文献中去除含有B检索词的文献。作用:缩小检索范围,提高查准率
布尔逻辑运算符的运算顺序是:not>and>or,( )改变运算顺序;逻辑符号前后要有空格
(2)截词检索:截词是指把检索词从某处截断,用特定的符号(截词符号)代替被截去的一个或多个字符。主要应用于西文数字资源的检索。截词符一般用“?”或“*”表示。作用:提高查全率。可分为无限截断(*)和有限截断(?) “*”代表0-n个字符,“?” 代表 0-1个字符;按截词位置可分为前截断(允许检索词前有若干变化)、后截断(允许检索词尾有若干变化)、中间截断(允许检索词中间有若干变化)
注意:不要滥用截词,不要截得过短;截词符号要用西文输入法;截词符号在外文数据库主要用于词尾和词中,而在中文数据库主要用于词中;?在不同的中文数据库中有不同规定,有的代表一个汉字,有的代表一个西文字符 (3)限定字段检索(限定检索词在数据库记录中一个或几个字段范围内查找文献信息的一种检索方法)作用:缩小检索范围,提高查准率(4)位置检索(是一种利用记录中的自然语言进行检索的检索技术。对两个检索词之间的相对位置进行限制)(邻近检索)目的:全文检索时应用,可提高查准率
常用位置算符:①(W)-With 两词之间紧邻、不可倒序②(nW)-nWith 两词之间最多有n个字符、不可倒序③(N)-Near两词之间紧邻、可倒序④(nN)-nNear 两次之间最多有n个字符、可倒序
(5)加权检索(能判定检索词或字符串在满足检索条件后对文献重要程度;运用加权检索可以命中核心概念文献;是一种缩小检索范围,提高检准率的有效方法)(6)其他检索技术:二次检索—也称“在结果中检索”,相当于逻辑“与”;精确和模糊检索;智能检索;词组检索:“”强制检索;跨库检索
扩大检索范围:逻辑或组合(OR)、截词检索、智能检索、跨库检索、模糊检索
缩小检索范围: 逻辑与组合(AND)、逻辑非组合(NOT)、限定检索、位置检索、加权检索、二次检索、精确检索、词组检索
19.多媒体信息检索技术 20.可视化信息检索技术
第二章 中文医学文献数据库
一.中国生物医学文献数据库(CBM)
1.数据库类型:生物医学文献书目型数据库 回溯期:1978年 数据月更新
2.标引依据:主题检索语言—《医学主题词表》(MeSH)(83个副主题词),《中国中医药学主题词表》(10个副主题词);分类检索语言—《中国图书馆分类法·医学专业分类表》
3.《医学主题词表》简称MeSH词表,著名中外医学数据库PubMed、Medline、CBM等都采用该词表作为主题词检索。MeSH表由字顺表和树状结构表两部分组成,树状结构表(将所有主题词按学科属性分出16大类,114个二级子类目,各子目录逐级展开,最多11级)是从学科分类角度对所有主题词进行编排而成的等级制分类表,是MeSH字顺表的姊妹篇。字顺表中的主题词一般均用正常的词序,使概念相近的词汇集在一起,有时也采用倒置词序,称为倒置主题词。
4.字顺表收词种类:a.主题词 b.副主题词(目前有83个):对文献主题起限定作用,用于描述某个主题范围内的某个方面。如药物副作用、疾病的诊断、治疗等。本身无独立检索意义,加在主题词之后,两者之间用“ / ”分开。能提高文献检索的准确性(查准率) c.款目词:即入口词,作用是将自由词引见主题词 d.特征词;如儿童
5.《医学主题词表》具有以下特点: 1)对医学文献中的自然语言进行规范,使概念与主题词单一对应 2)保证文献的标引者和检索者之间在用词上的一致3)可进行主题词、副主题词组配,提高主题标引或检索的专指度4)可以对主题词进行扩检和缩检5)具有动态性
6.数据库结构 :CBM有540万余条记录组成,每条记录有若干字段构成,各字段有其特殊的含义。
AB—摘要 ,AD—著者单位(地址),AU—作者,CT—特征词 ,IP—期,IS—ISSN,PY—出版年
LA—语种,PT—文献类型,MH—主题词,SO—出处,TA—刊名,TI—中文标题,TW—关键词
7.检索规则1)布尔逻辑运算符:“AND” 、“OR” 和“NOT” ;模糊/精确检索:适用于关键词、主题词、作者、刊名等字段;强制检索:检索词含有特殊符号“-”、“(”等,用英文半角双引号标识检索词
8.快速检索:系统默认的检索方式,默认在全部字段执行智能检索。支持布尔逻辑检索、截词检索、二次检索(在已有检索结果基础上再次检索,逐步缩小检索范围,两个检索式之间的关系为AND逻辑运算)、短语检索。智能检索能自动实现检索词及其同义词的同步扩展检索,能将输入的检索词转换成表达同一概念的一组词,自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。智能检索不支持逻辑组配检索。
9.高级检索:1)限定字段检索:系统默认常用字段检索,常用字段是中文标题、摘要、关键词、主题词的组合2)精确/模糊检索3)限定条件检索
10.主题检索:1)主题词检索:主题词扩展检索(表示对当前主题词及其所有下位主题词进行检索。系统默认状态为“扩展”。),主题词加权检索(表示仅对文献记录中加星号(*)主题词(主要概念主题词)检索。系统默认状态为非加权检索),主题词/副主题组配检索,副主题词扩展检索(扩展:指对当前副主题词及其下位副主题词进行检索;不扩展:则仅限于对当前副主题词进行检索)2)主题词浏览
11.分类检索:1)类名类号检索2)分类导航浏览
12.期刊检索:1)检索途径:刊名检索,出版地或出版单位检索,期刊主题词检索,ISSN检索
2)导航浏览:期刊分类导航,首字母导航
期刊检索途径与高级检索中“刊名字段”检索比较共同点:查找期刊文献;期刊检索的优点:定位目标期刊,获得全面期刊信息(编辑部电话、邮箱等),全面了解某学科主题方面的期刊分布,解决期刊更名带来的烦恼
13.作者检索与高级检索中“第一作者字段”检索比较共同点:查找某一作者的文章;作者检索的优点:作者索引,限定第一作者的单位
14.机构检索可以了解指定机构作为第一机构的论文发表、被引等相关信息;可利用机构名称直接检索,也可以通过机构分类导航或机构名称首字母导航逐级浏览查找所需机构
15.基金检索可帮助用户查找特定基金项目的成果发表情况。可以直接在检索输入框键入基金名称或基金项目,也可通过分类导航逐级浏览。
16.引文检索从被引文献的题名、主题、作者/第一作者、出处、机构/第一机构、资助基金等字段查找引文。可帮助用户了解所需文献在生物医学领域的被引用情况
17.检索历史:1)查看检索历史2)进行逻辑组配检索
18.检索结果的管理:(一)检索结果显示:单页记录显示条数(系统默认每页显示20条);排序方式:入库、年代、作者、期刊和相关度5种排序方式。系统支持的最大排序记录数为6万条;显示格式:题录格式、文摘格式两种(二)检索结果分类 :核心期刊、中华医学会期刊和循证文献(三)检索结果统计分析:分析内容:主题、学科、期刊、作者、时间、地区;统计分析数量:CBM最大支持200000条文献的结果统计 分析结果显示:默认显示10条(10-50条)(四)检索结果输出:输出方式:打印、 保存、E-mail和写作助手4种;输出数量:单次“打印”、“保存”的最大记录数为500条,单次“E-mail”发送的最大记录数为500条;输出范围:全部记录、标记记录、当前页记录、输入记录
二.中国知网(CNKI)
1.数据库概况
2.检索方法(1)基本检索:跨库检索是指以同一检索条件同时检索多个数据库(文献:默认检索期刊、博硕士、会议、报纸四种文献类型;“主题”字段不是主题词检索,指在篇名、关键词和摘要字段中同时检索
);单库检索是在单一文献类型的数据库中检索;
(2)高级检索:1)跨库检索2)单库检索:中国学术期刊(网络版)是世界上最大的连续动态更新的中国学术期刊全文数据库,收录自1915年至今出版的期刊,部分期刊回溯至创刊;博硕士学位论文数据库目前国内相关资源最完备、高质量、连续动态更新的中国优秀博硕士学位论文全文数据库,收录年限:自1984年至今的博硕士学位论文。优先出版:是以印刷版期刊录用稿件为出版内容,先于印刷版期刊出版日期出版的数字期刊。国内外重要会议论文全文数据库是由国内外会议主办单位或论文汇编单位书面授权并推荐出版的重要会议论文,收录年限:自1953年至今的会议论文集。(3)出版物检索
3.检索结果管理(1)检索结果分组筛选:分组分析方法(学科类别、发表年度、研究层次、作者、机构、基金、文献类型、资源类型、文献来源、关键词 );排序分析方法(主题排序(相关度)、发表时间、被引频次、下载频次)。(2)检索结果分析与阅读:查看文献间的引证关系,最多可分析200篇文献;支持单篇和多篇文章在线阅读:多次检索结果汇聚同时阅读,最多同时阅读50篇文献。(3)检索结果输出:题录可以批量下载,多次检索结果汇聚统一下载,每次最多可下载500条。全文每次只能下载1篇,借助CNKI E-Study文献管理软件可批量下载相关文献。PDF要用Adobe (Acrobat) Reader 浏览器来打开。
CAJ与PDF阅读器基本功能:阅读功能—连续页、原版、放大;导航功能—页面缩略图导航、目录导航;摘录功能—文本摘录、图像摘录;文档存储功能—word、txt格式;标注功能—高亮线、各种划线、注释等
CAJ独有功能:屏幕取词、划线连接—链接工具书,概念解释等
引文/参考文献格式:涂新枝,王晨虹,李胜利,陈丽华,曹宇. 妊娠早期被动吸烟与胎儿畸形关系的队列研究[J]. 中国优生与遗传杂志,2013,21(04):127-129.(作者,题名,出处)
4.知网节是知识网络节点的简称,是提供单篇文献的详细信息和扩展信息的浏览页面,是该文献各种扩展信息的入口汇集点;知网节以一篇文献作为其节点文献,知识网络的内容包括节点文献的题录摘要和相关文献链接。
三.维普期刊资源整合服务平台
1.数据库概况: 收录年限:1989年至今的12000余种期刊
2.检索方法:⑴基本检索:时间限定,期刊来源限定,学科范围限定,字段限定 ⑵传统检索:导航浏览检索;查找同义词、同名作者、二次检索 ⑶高级检索:检索执行的优先顺序:严格按照由上到下的顺序进行,用户在检索时可根据检索需求进行检索字段的选择 ⑷期刊导航 ⑸检索历史
3.检索结果管理: ⑴检索结果的显示 ⑵题录可批量下载,最多保存200条,文本格式;可打印⑶全文下载:不能批量下载
四.万方数据知识服务平台
1.数据库概况: 文献类型包括学术期刊、学位论文、会议论文、专利、法律法规;学术期刊: 1998年以来 ;学位论文数据库:1980年以来
2.检索方法:1)跨库检索:指以统一检索条件同时检索多个数据库,包括简单检索,高级检索
2)单库检索:期刊论文数据库,学位论文数据库,会议论文数据库,外文文献数据库
3.检索结果管理(1)查看检索结果 ⑵查看论文详细信息 ⑶题录与全文下载
第三章 外文医学文献数据库
一.MEDLINE
1. MEDLINE概况:研制开发单位:美国国立医学图书馆(NLM) 数据库类型:书目型西文生物医学文献数据库 回溯期:1946年 标引、检索依据:MeSH
2.检索平台:网络版:NLM下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的PubMed;OVID公司在OvidSP平台上提供的MEDLINE;EBSCO公司在EBSCOhost平台上提供的MEDLINE with Full Text;各版本数据相同,但处理方式、检索规则有差异
二.PubMed数据库
1.数据库概况:研制单位:NLM下属的国家生物技术信息中心NCBI;数据库类型:生物医学文献书目数据库,是MEDLINE数据免费检索的网络版;回溯期:1946年;Free full text links:提供部分免费全文的链接;是Entrez生命科学综合信息检索系统系列数据库中的一个
PubMed的收录范围:(1)MEDLINE数据: Pubmed数据的主体部分,检索记录带有[PubMed-index for medline]
(2)PreMEDLINE :过渡阶段的临时数据库,NLM正在加工、评审和标引的数据,检索记录带有[PubMed-in process](3)Publisher Supplied Citations: 出版商最新提供的数据,检索记录带有[Pubmed-as supplied by publisher];超出MEDLINE收录范围的数据,检索记录带有[PubMed]; 如果出版商提供的文献先于纸质期刊出版在网上发行,则还带有[Epub ahead of print]标记。(4)OLDMEDLINE(1946-1965,尚未完成Mesh词更新而未转入MEDLINE的数据),标记为[Pubmed-OLDMEDLINE]
2.检索方法:1)基本检索:自由词检索( 检索原理:自动词语匹配功能 );作者检索;期刊检索;布尔逻辑检索:AND、OR、NOT,须大写,左→右,括号内优先,系统默认空格为AND检索;截词检索(*代表0到任意个字符,不限于单词,ATM关闭);字段检索([], ATM关闭,例如 high blood pressure[TI]);强制检索(“” ,例如 “kidney failure” ,不进行词汇的自动转换及短语拆分,ATM关闭,直接到“所有字段”中检索,“kidney failure” [All Fields]
检索原理:自动词语匹配(ATM);输入没有任何限定的检索词时,系统依次在以下六个表中进行匹配、转换和检索;MeSH Translation Table:自动对主题词及其下位主题词、副主题词扩展检索,同时用它在所有字段中检索;Search details:查看或修改检索式
作者姓名书写格式:输入格式: [名+姓 或 姓+名 或 姓+名(首字母)]
期刊检索:键入刊名全称,键入刊名标准缩写形式(MEDLINE格式),缩写名,期刊的ISSN号,如果刊名容易与一般词汇混淆,必须限定在刊名字段检索,如:cell[TA]
2)限定检索3)高级检索(构建检索表达式,检索历史—可查看逻辑组合检索表达式,最多保存100条检索式,保存8小时)4)其他辅助检索:主题词数据库,期刊数据库(提供刊名缩写和刊名全称的转换查询。可通过输入关键词、刊名全称、缩写名、ISSN查询期刊信息),特定文献检索(单篇引文匹配,批量引文匹配)
3.检索结果管理:1)检索结果显示:显示格式:Summary(Summary text):默认格式,包括作者、团体作者、篇名(非英文篇名英译后加方括号)、文献来源、综述(文献类型)、非英文文献的原文语种、“无文摘”注释、PMID、评论/校正链接、数据加工状态、免费全文提示;Abstract:Summary格式基础上加文摘、著者单位、地址;MEDLINE : 最完整,有字段标识符
2)检索结果输出:题录输出;全文输出:PubMed Central(PMC)是NCBI开发的免费电子期刊全文数据库,期刊网站提供的免费全文
两种全文格式的区别:1)HTML格式:丰富的链接,更多的资源;图表放大;可使用在线词典;格式不规范,篇幅大 2)PDF格式:国际标准格式,格式规范;篇幅小,美观,易于携带
其他辅助功能:文献按年代分布图,标题中含有检索词的文献,PMC中免费全文,查找Entres中其他数据库,检索细节(详细检索表达式),最近5次检索
4.个性化服务:利用My NCBI账户可以保存、修改编辑和重新调用检索式(Saved Searches),保存检索结果(Collections)和个人文献目录(My Bibliography)
PubMed数据库的数据库类型,文献标引依据、回溯期?
PubMed数据库的检索原理是什么?什么情况下系统不按检索原理执行检索?
如何在PubMed数据库中查看或修改检索表达式?
三.OVID电子期刊全文数据库
1.数据库概况:平台资源:100余种数据库(医学为主,MEDLINE);2000余种全文期刊(我校购买500余种)。回溯期:1993年。我校订购了总共500多种刊(可免费检索、获取全文)。
2.检索方法:1)检索功能:1. Basic Search(基本检索,默认检索模式,不支持布尔逻辑运算符)2. Find Citation(引文检索)3. Search Fields(字段检索)4. Advanced Search (高级检索 )5. Multi-Field Search(多个字段检索,提供多个检索词在不同字段进行逻辑组配检索)6.Search History(检索历史,可根据需要勾选检索式后用And、Or进行逻辑组合(高级检索界面))2)期刊浏览功能
3.检索结果管理(1)检索结果显示:开放存取资源(限于基本检索结果页面) ⑵检索结果筛选:限于基本检索结果页面 ⑶检索结果输出:全文输出:OVFT的全文一般有HTML格式和PDF格式,有的只有其中一种格式;HTML全文界面电子邮件发送:Email Article Text:邮箱发送的是全文为文本格式,不含图表;Email Jumpstart:邮箱发送的是全文链接的网址
4.高级检索中“关键词”字段检索范围:文章标题、文摘、全文及标题文本。
四.EBSCOhost全文数据库
1. 数据库概况:MEDLINE with Full Text是EBSCOhost平台中,非常权威的医学文献数据库(文摘和全文)
2.检索方法:布尔逻辑检索,截词检索,强制检索(1)默认新检索即高级检索(New Search --Advanced Search)(2)主题检索(MeSH 2015)(3)出版物检索(Publication)(4)图像检索(Image)(5)检索历史(Search History)3.检索结果管理:检索历史
五.Science Direct
1. 数据库概况:2.检索方法:⑴基本检索 ⑵高级检索 ⑶浏览功能
检索规则:1)默认检索顺序:OR-W/n | PRE/n -AND -AND NOT 2) 使用( )限定检索次序
注:字段名和布尔逻辑运算符均不区分大小写;字段名既可以用字段全称,也可以用简写编码
3.书刊导航浏览:按书刊题名字顺浏览,按学科主题浏览,开放存取书刊浏览
4. 检索结果管理(1)检索结果显示 ⑵检索结果筛选:年代(Year)出版物名称(Publication Title)主题(Topic)文献类型 ⑶检索结果输出:题录输出,全文下载
讲过的中外文数据库中哪些数据库具有检索历史功能?哪些数据库具有主题词(MeSH)检索功能?
第四章 引文数据库检索
1.引文:指被引用的文献,即文献后所附的参考文献,,是指为撰写或编辑科技文献而引用或参考文献资料的著录,通常附在论文、图书章节之后,有时也可以注释(附注或脚注)的形式出现在正文中。其著者称为被引著者(Cited Author)。
2.基本概念:引用文献(Citing Paper)又称引证文献,指文后附有参考文献的文献,其著者称为引用著者(Citing Author)。来源文献(Source Article)指引文数据库收录的文献,对应引用文献。引文数据库的被引文献索引可以查到来源文献的所有参考文献。被引用文献(Cited Paper),即引文。指列于文献末尾的参考文献(Reference)。同被引(co-citation)若两篇文献共同被后来的一篇或多篇文献引用,那么这两篇文献之间是同被引关系,同被引频次越高,则其相应文献间的关系越密切。引文检索(Cited Reference Search)是以被引文献为检索起点来检索引用文献的过程。引文索引是按照文献的引证与被引证的关系进行排列而成的,用以揭示科技文献之间引用和被引关系的检索工具。
3.影响力最大是Web of Science核心合集( Web of Science Core Collection,WOSCC),包括三个著名的引文索引数据库、两个会议录文献引文索引数据库、两个图书引文数据库和两个化学数据库,内容涵盖所有学科门类
4. ★ 7大引文索引数据库包括:
Science Citation Index Expanded (SCI-Expanded,科学引文索引扩展版,1986年至今)
Social Sciences Citation Index (SSCI,社会科学引文索引,1900年至今)
Arts & Humanities Citation Index (A&HCI,艺术与人文引文索引,1975年至今)
Conference Proceedings Citation Index-Science (CPCI-S,科学会议录引文索引,原Index to Scientific & Technical Proceedings,ISTP,1990年至今)
Conference Proceedings Citation Index-Social Science & Humanities (CPCI-SSH,社会科学与人文科学会议录引文索引,原Index to Social Science & Humanities Proceedings,ISSHP,1990年至今)
Book Citation Index-Science,BKCI-S(科学图书引文数据库,2005年至今)
Book Citation Index-Social Science & Humanities,BKCI-SSH(社会科学与人文科学图书引文数据库,2005年至今)
★ 2个化学库
Current Chemical Reactions(CCR Expanded,最新化学反应数据库,1986年至今)
Index Chemicus(IC,化学物质索引,1993年至今)
SCI(科学引文索引):是由美国科学信息研究所ISI,1961年创办出版的一部世界著名的大型学科检索工具,按来源期刊数量分为SCI和SCI-E,SCI收录期刊3700余种(印刷版、光盘版)和SCI-E, SCI-E收录期刊8300多种(网络版和Dialogue国际联机版)。SCI-Expanded是SCI的网络版(扩展版),
5.影响因子(IF):在一定时期(通常是前两年)内,某一刊物发表的论文,被已经进入SCI刊物的论文在当前年所引用的总次数,除以该刊物这一时期内的论文总数,即为该刊物的影响因子。
SciELO:提供免费全文的链接(均为开放获取,即免费访问)
6.检索规则/功能:支持布尔逻辑运算符NOT、AND和OR,不区分大小写,系统默认空格为AND运算。在各个检索字段中,检索运算符的使用会有变化。在“主题”字段中可以使用 AND,但在“出版物名称”或“来源出版物”字段中不能使用。其运算顺序为( ) → SAME→ NOT → AND → OR。当这些运算符不作为运算符,而作为检索词的一部分时,要用双引号标识检索词,将其作为一个整体进行检索。 检索词不区分大小写:可以使用大写、小写或混合大小写。截词检索。强制检索。
7.常用中文引文数据库:1. 中国科学引文数据库(CSCD,需订购)2. 中国知网引文检索(CNKI,免费)2.1 “文献”跨库检索状态下选择(“引文”检索)2.2 “期刊”单库检索(“参考文献”字段)2.3 中国引文数据库(高级检索)3. 万方知识服务平台4. 维普期刊资源整合服务平台(文献引证追踪)5.中国生物医学文献数据库CBM (引文检索)
第八章 网络信息资源检索
1.网络信息资源是指通过计算机网络可以利用的各种信息资源的总和
2.网络医学信息资源的类型按信息的用途划分1)搜索引擎(Search Engine)和馆藏联机目录(Online Public Access Catalog,OPAC) 2)数据库类资源(Database Resources)3)电子出版物资源(Electronic Publication Resources) 4)医学教育信息资源(Medical Education Resources) 5)其他医学信息资源。按医学信息的专业内容划分:1)综合医学网站资源 2)专科医学网站资源
3.网络信息资源的特点1.信息的多样性 2.信息的新颖性3.信息的交互性 4.信息组织的局部有序性和整体无序性5.信息的开放性
4.搜索引擎的定义:是指根据一定的策略、运用特定的计算机程序搜集互联网上的信息,对信息进行组织和处理后,为用户提供检索服务的系统
5. 搜索引擎的类型:根据工作方式分类1. 目录式搜索引擎(Yahoo!、搜狐、新浪)2. 全文搜索引擎(百度、中搜) 3. 元搜索引擎(WebCrawler、Metacrawler、Dogpile) 根据检索内容分类:1. 综合性搜索引擎(Yahoo!、百度)2. 专业搜索引擎(Medscape、Health on the Net(HON)、MedExplorer) 根据组合方式分类:1.独立搜索引擎(仅限在单个搜索引擎建立的数据库中进行信息查询,查询语言及规则必须符合该数据库的特定要求)2.元搜索引擎(集成化搜索引擎,通过统一的用户界面,同时调用多种独立搜索引擎,提供去重后的检索结果。其优点是搜索面广,检索信息量大)
6.综合性搜索引擎(1)Baidu (Baidu百度是全球最大的中文搜索引擎、最大的中文网站) 1)检索规则:布尔逻辑检索(逻辑“与”用空格;逻辑“非” 在检索词前加减号“-”,减号前要留一空格);精确匹配(用半角引号或书名号《》括起词组或短语);指定范围检索(检索词前用位置代码加冒号“:”,可限定检索词出现在网页的标题、正文等指定位置。);文件类型限定检索(在检索词或检索式后空格加上filetype:文件类型扩展名);采用关键词搜索。2)检索方法:基本检索,高级搜索
(2)其他:. Yahoo!, Ask,Lycos,Excite,Live search,新浪,搜狐
7.医学专业搜索引擎:HON(非营利性组织健康在线基金会,推出三个全文医学搜索引擎。分别为: MedHunt, HONselect,HONcodeHunt),Medscape(注册用户可享受更多的服务,免费注册),其他常用医学网络检索工具(Medicinenet,MedExplorer,Medchoice,Oncolink,Health,39健康网)
MedHunt检索规则:英文关键词对大小写不敏感,词组检索加半角引号,不支持逻辑运算符和中文关键词,使用“-”排除一些关键词,使用“*”作为截词符。HONselect具有主题词检索功能。
8.网络免费信息资源:(1)开放存取学术资源 “开放存取” (OA):是利用网络实现科研成果在全球范围内共享的一种学术出版模式—把同行评议过的科学论文或学术文献放到互联网上,使用户可以免费获得,而不需考虑版权或注册的限制。基本特征:“作者付费发表,读者免费使用”。主要的开放存取出版模式:开放存取期刊(类型:Free Medical Journals,High Wire Press,Biomed Central,Pubmed Central,DOAJ,PLOS),开放存取仓储(开放存取仓储是收集存储由个人或一到多个机构产生的知识资源和学术信息资源,提供社会共享的信息资源库。开放存取期刊的区别在于前者的综合性,后者以某一类型信息资源为主,两者之间有时也有交叉重复。包括OpenDOAR ,Socolar 开放存取资源, 国内外大学OA仓储资源,国内外较权威的电子预印本资源)(2)生物医学图像资源:医学图谱网站,综合和医学专业搜索引擎(HON等)
(3)网络参考工具:在线医学词典(medi-lexicon 医学词典,有道辞典),国内重要医学网站(丁香园,小木虫,生物谷,中国医药信息网,好医生网站,中国金药网),国外重要医学网站(美国国立卫生研究院,美国国立医学图书馆,美国国立生物技术信息中心,美国食品与药品管理局,美国疾病控制与预防中心,世界卫生组织)
第九章 全文获取
1.常用的全文获取途径:1图书馆馆藏:印刷版馆藏+电子版馆藏2开放获取资源和搜索引擎3向作者索取全文4网站互助和试用数据库5文献传递(读者自助文献传递:超星百链云,万方数据库外文文献全文传递,馆藏联合目录查询(中国高等教育文献保障系统CALIS,国家科技图书文献中心NSTL:印刷本文献资源,网络版全文文献资源);向学科馆员求助学科服务)
2.中文(无全文):CNKI中国知网(购买知网卡获取全文,手机版),维普期刊资源整合服务平台,万方数据知识服务平台。外文(部分有全文):PubMed。
第十章 医学信息管理与利用
1.检索策略的含义:检索策略是为实现检索目标而制定的全盘计划和方案,包括分析检索课题、数据库选择、检索途径、设计检索式和调整检索式等步骤。检索策略的制定是文献检索全过程的重要环节
2.检索策略的制定:一明确检索内容,选择检索工具:1数据库的类型 2数据库的学科范围、语种、文献类型、收录规模、收费情况等;二选择检索途径1.分类途径2.主题途径3.关键词途径4.著者途径5.引文途径6.题名途径7.机构途径8.刊名途径9.默认途径;三选择检索词:1.主题词检索2.自由词检索3.主题词和自由词结合(平衡查全率和查准率)
3.检索策略的调整:(一)评价文献检索效果最常用的两个指标为查全率(.查全率指用户从检索系统中检出的相关文献量与检索系统中相关文献总量的比率,即:查全率=检出相关文献量/系统中全部相关文献总量×100%)和查准率(查准率指用户从检索系统中检出的相关文献量与检出的文献总量的比率,即查准率=检出相关文献量/检出文献总量×100%)(二)扩检(扩大检索范围)和缩检(缩小检索范围)
扩检:(1)检索词的选用:①尽量使用主题词检索 ②主题词和自由词同时使用(2)调整检索技术:①删除用逻辑运算符“and”连接的不太重要的检索词②增加用逻辑运算符“or”连接检索词③使用截词符(截得过短,降低检准率)④使用默认字段(缺省字段)、任意字段和全文检索⑤放宽限制条件⑥用分类号或相关作者补充检索(3)控制检索范围:①检索多个数据库②通过跨库检索平台检索
缩检:(1)检索词的选用:①提高检索词的专指度,尽可能选用下位主题词检索②使用主要主题词检索(加权检索)③选择与检索要求相对应的副主题词,不宜选用全部副主题词(2)调整检索技术:①增加用逻辑运算符“and”连接检索词,或使用二次检索②使用逻辑运算符“not”排除无关记录③使用限定字段检索,将检索词限定在主要字段④增加限制条件(3)控制检索范围:①选择专业数据库②在更专指的分类范围内检索
4.检索实例分析:一、检索词的选用 例 AcSDKP防治心肌梗塞后心肌纤维化的作用机制
1分析课题,确定主题概念a.显性概念:AcSDKP;心肌梗塞;心肌纤维化(myocardial fibrosis)b. 隐性概念:心肌纤维化的防治;心肌保护;抑制心肌成纤维细胞增;2选择数据库;3选择检索途径;
4拟定检索词:主题词检索(1)心肌梗塞—心肌梗死(2)心肌纤维化—心内膜心肌纤维化症(3)AcSDKP(无主题词)(4)心肌纤维化的防治(无主题词)(5)心肌保护(无主题词)(6)心肌成纤维细胞增生(无主题词)5.制定检索式(利用显性概念检索,利用隐性概念检索)二、调整检索技术,利用隐性概念检索:心*保护;心*纤维细胞增生;心脏成纤维细胞 or 心肌成纤维细胞三、控制检索范围:加权检索;扩展检索
5.文献获取原则:先中文后英文,先综述后实验型研究论文,先文摘后全文,先电子型后印刷型
6.文献管理软件的主要功能:文献检索和数据输入,文献管理,相关文献的引用,自动转换论文格式
常用的文献管理软件有哪些?NoteExpress:更适合中文文献;CNKI E-Study;EndNote更适合中文文献
中文数据库类型:书目型数据库:CBM(中国生物医学文献数据库)全文型数据库:中国知网、维普期刊资源整合服务平台(期刊)、万方数据知识服务平台(检索平台)
CBM:检索途径1快速检索:智能检索、二次检索2高级检索:限定字段检索;精确/模糊检索;限定条件检索标引依据:1主题检索语言:《医学主题词表》(MeSH)(83个副主题词)《中国中医药学主题词表》(10个副主题词)2分类检索语言:《中国图书馆分类法·医学专业分类表》
常用开放存取资源有哪些?主要的开放存取出版模式:开放存取期刊,开放存取仓储1. Free Medical Journals(4832种,部分免费)2. High Wire Press(1200种,部分免费)3. Biomed Central(200种,全部免费)4. Pubmed Central(1239种,全部免费)5. DOAJ(6430种,综合性,全免费)6 . PLOS (11种,全免费)
PubMed全文格式的区别:HTML格式:丰富的链接,更多的资源;图表放大;可使用在线词典;格式不规范,篇幅大。PDF格式:国际标准格式,格式规范;篇幅小,美观,易于携带
PubMed基本检索分类:自由词检索(检索原理:自动词语匹配功能);作者检索;期刊检索;布尔逻辑检索;截词检索;字段检索;强制检索
中文数据库类型:书目型数据库:CBM(中国生物医学文献数据库)全文型数据库:中国知网、维普期刊资源整合服务平台(期刊)、万方数据知识服务平台(检索平台)
CBM:检索途径1快速检索:智能检索、二次检索2高级检索:限定字段检索;精确/模糊检索;限定条件检索标引依据:1主题检索语言:《医学主题词表》(MeSH)(83个副主题词)《中国中医药学主题词表》(10个副主题词)2分类检索语言:《中国图书馆分类法·医学专业分类表》
#讲过的中外文数据库中哪些数据库具有检索历史功能?哪些数据库具有主题词(MeSH)检索功能?
#列举免费检索的中外文引文数据库的名称。